1908年10月底，混成协开始整编，秦浩任协统，陈亮、陈涛任标统人员暂编5000人，秦浩他们没有把巡防营成建制编到混成协，而是抽调5000人组编新军，巡防营人数虽只有原来的一半，但编制是齐全的。
混成协按十营编制，两个步兵标6个营，警卫、工程、炮兵、骑兵各一营。练兵处来人任参议官、教练官。由陈涛训练，驻防临安。
由于现在和庆王爷的关系到位，一系列人员都进行了打点，人员任命均顺利的按云南上报任命，现在混成协仍和巡防营一样外人很难**。
其实，秦浩这段时间根本就很少过问军队的问题，全在处理周边关系了。
秦浩的部队在动乱时期的表现，非常出色，附近几个总兵对于秦浩军队的装备都很感兴趣。动乱刚结束，刀安仁和张文光就又来到了红河，两人是革命党云南省的重要成员，刀安仁是世袭土司，曾两次留学日本，是云南较早的留学生，主要学习的是农业。历史上，他们是辛亥革命云南首义，但但当时的革命党，对少数民族很是歧视，云南安定后，被剥夺了军权，迫害致死。现在刀安仁是腾越总兵副将（土总兵）握有十个巡防营，腾越路一半的兵力。这几年，和红河交往密切，在秦浩他们的支持下，橡胶园已经种植了50万棵，本来他就是个很务实的革命者，在秦浩等的劝说下这次没有参加起义，很受革命党的责备，但经过此事后更加靠近了秦浩，秦浩他们也在尽力帮助刀安仁建立改善民生的项目，努力提高刀安仁辖区的人民生活，赢得了刀安仁和他的族人的尊重。这次刀安仁带来了10名学生想进红河军校学习，并请秦浩给他派十名军官帮助训练军队。秦浩答应了他，并送他1000支步枪。
广西左江总兵龙光济是蒙自人，右江总兵陆荣庭都多有军火上的来往，相互关系很好。使秦浩和红河的外部环境更见建好。
而政治上，朝廷上谕立宪，各省正忙着议员选举，地方自治。吵吵闹闹，全国官场好不热闹。秦浩也在忙前忙后，浑水摸鱼。到了11月14、15日光绪、慈禧相继死去，朝廷一片混乱，朝廷大员忙着分权，地方大员赶赴京师吊孝。云南问题再也无人关注。
云贵总督锡良平定乱党表现出色，建设地方卓有成效，又是满人出身，而满朝满人都多难当大任，而现在乱党猖獗，满清江山摇摇欲坠，满人贵族对袁世凯很不放心，满人中稍有能为的都被委以重任，而锡良能力出众，当然要大力提拔。所以锡良这次入京被派到了更加重要的大清朝的根基东北三省任总督，以稳固大清基业。云南以布政使沈秉臻护理云贵总督。
红昆铁路在比较务实的锡良和沈秉臻的关照下，到09年2月18日，红河到昆明顺利通车，路经通海、玉溪全长210公里设置了十多个车站。秦伟根据后世的技术和眼光，采用了不少比较先进的工艺技术，采用了英国的标准轨矩作标准，和我国已经建成的京汉铁路使用一个标准，为以后的接轨做准备。
机车、车厢全是南华机械厂（中华重工）刚成立的红河车辆厂生产的蒸汽机车，对当前各国的机车进行了对比，由王宏对其进行了不少的革新，定型制造的，可以说是目前最先进的机车。
红昆铁路由南华工程公司5万员工，用10个月的时间圆满的完成了这一工程。南华最大的收获不只是建成了铁路，还在于按照秦浩他们的设计，通过有组织的施工工程，建立了严格的团队管理制度，本身南华公司就是部队建制，正式加入南华工程公司的员工，就是按工程兵部队建设管理的。这是一支强大的预备役，何况他们每年还要有不少于三个月的正常的军事训练，义军的兵员补充，一个是新兵营，一个就是工程兵。而工程兵是可以光明正大建设的，只要有工程任务。所以，秦浩他们才对工程和工程兵建设如此重视。
在沈秉臻的帮助下，南华公司得到了玉溪和通海的两处采矿权。这也是云南的两处富铁矿（这时无人知道），有很高的开采价值，对红河钢铁公司的后劲发展有极大的益处。
按照秦伟的设计铁路1909年底，可通到六盘水。由于白牛厂银矿的开采，冶炼已经成功，现一年可得白银2000多万两，在周羽的直接领导下，南华公司正在储备着黄金。而铁路资金虽不需要在借外资，考虑到国外形势，还是要借，多借。在国内只对国内筹股1000万两，其他由南华公司投资。
红河到南宁的铁路，朝廷已经批准，在周羽的运作下，几国列强都逼着朝廷要给贷款，朝廷现在是多事之秋，慈禧死后，宣统只是个顽童，摄政王软弱无能，本就已经焦头烂额，对偏远的云南根本不重视，没有大乱就行，现在列强紧逼，内部民怨沸腾，只好把两条铁路都批给云南南华铁路股份公司商办，让列强去找华南铁路公司商议。在南华公司周羽主持的谈判中，南华坚持资金够用不用借，如果几国要借，就按德国马克结算，最后法国、英、德、美硬借给价值6000万两白银的低息贷款。现在两条铁路也不要自己掏钱修建了。皆大欢喜。
华南铁路公司和南华工程公司在做着两条铁路的修建准备工作，现在资金充足，工程公司也趁机把人员扩编到了10万人，达到了计划人数。工程公司现在已经完成了技术积累，成了一支很强的工程队伍。铁路工程正常继续施工着。
公路最后由官府出20万两，士绅捐款20万两，和南华公司出资，在年底从昆明经红河到百色的公路修通，路宽7米，石子路面，全长840多公里。
王宏到昆明机器局后，调整部分设备，从南华公司抽调500多人，现在可以生产子弹，部分炮弹，步枪。在沈秉臻和王振畿的帮助下，正式被任命为总办，现在在王宏的主持下，生产普通枪弹。
1908年云南陆军讲武堂筹备时，王振畿推荐秦浩任总办，锡良对秦浩的实力太大不放心，让陈宦任总办，而日本留学的李根源回国担任会办。年底陈宦随锡良到东北上任，在沈秉臻的活动下，陈涛出任尚在筹备的云南讲武堂总办。云南讲武堂开始招生。在此之间大批留日学生回国，到云南的讲武堂和云南新军中任职，由于锡良对留日学生的重用，秦浩他们也没有能阻止，同盟会在云南新军的发展壮大，自此决定了云南新军必定为同盟会所用。
本来想在新军中，控制一些力量的秦浩他们，现在只能，发展自己的力量，加大军校军官、士官的培养，军官十个专业近三千学员，进行中低级军官教学，第一、二期毕业生，一部分留校担任教学任务。士官，军校中只有军事技术士官的培养，在军校，而通用技术专业，都到新开办的职业技术学院学习，例如汽车驾驶，汽车维修；卫生员，炊事员等。加大工程兵的军事技术的轮训力度，工程兵的驻地在牛头山基地，对外讲是三个月回基地轮休一次。
1909年4月，沈庄来到红河，找到秦浩，说：
“昨日接报，广西巡抚李经羲调任云贵总督，大哥调任广西巡抚。大哥想知道你怎么看。”
“既然李经羲来云南任总督，大哥到广西也是好事，只是现在世道太乱，得有武力，我们到昆明去一趟。”秦浩原就知道沈秉臻会去广西，现在已是一派，得要做些安排。
第二天，秦浩、沈庄带着陈涛坐车去了昆明。
到了沈秉臻府上，秦浩先给沈秉臻到了喜，客气几句，进入话题。
“大哥，以你的资历任广西巡抚是应该的，去广西任职有不少好处，离两广总督较远，对于广西事务你可以做主，不再事事受制于人。云贵总督已经有人，在云南也没意思，何况现在云南新军搞的太乱，早晚要出事，现在去广西更好，有可能是锡良帮的忙，得谢谢他。但现在太乱，没兵没权没人听你的，我让我老三陈涛带些兵随你去桂林。您看怎么样。”秦浩把现在的形势和沈秉臻分析了一下。
“那太好了，我也分析了广西的情况，军队新军是李经羲的人，而且新军还有内斗，广西新军人数也太少，旧军是龙济光和陆荣庭的，没人会听我的。现在桂林的新军协统蔡锷已去职，协统空缺，陈涛去正好，各方面都会给面子，正好我们好重新编练新军，成立一镇。”通过这几年的接触，相处。知道小弟的这个结拜兄弟，可不是一般的厉害，他这个安排太好了。
“那行，我让老三带四营新军，装备齐全，随大哥去广西，再有需要，让老三到滇南来要，钱、枪、人都行。另外在给大哥十来个搞经济的人，带头的叫金鑫羽，是南华公司的，政治经济水平都可以，你可以放心的用，也好帮助大哥。大哥到广西后，安排个亲信，任北海知府，新军安排一标人马到北海，南华公司要在那里建一个大型造船厂，我也会安排些人手到那里保护。”秦浩答应了沈秉臻，又商量了点事情，就回了红河。
1909年5月18日，原广西巡抚李经羲到云南就任云贵总督。藩司世增，提法司杨福璋，提学司叶尔恺，提督张松林，临安开广道龚心湛，临元镇总兵、临安路巡防营统领秦浩，临安知府吴昌祀和云南的部分官员到昆明迎接新任总督李经羲。（李经羲，李鸿章的侄子，多年在总理衙门从事外事工作，后放外任，多年任职地方，政绩一般，派性很强。）
1909年5月28日，护理云南总督沈秉臻启程到桂林就任广西巡抚，他从昆明乘火车到红河，乘汽车到百色，再经南宁到桂林。陈涛带四个营和一批军官随沈秉臻到桂林上任，训练广西新军。
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