此外华陀的传奇故事也很多。其中流传最广的，当属他与当时的政治家文学家曹操的一段传奇故事。
据三国野史记载，华陀的同乡曹操，常患头风病（也就是现在所说的偏头疼），请了很多医生治疗，都不见效。偶然听帐前幕僚说华佗的医术高明，就请他来医治。华佗只给他扎了一针，头痛立止。曹操怕自己的病再复发，就强要华佗留在许昌做自己的侍医，供他个人使唤。华佗禀性清高，不慕功利，不愿做这种形同仆役的侍医。加上他“去家思归”就推说回家乡找药方，一去不返。
曹操几次写信要他回来，又派地方官吏去催。华佗又推说妻子病得厉害，不肯回来。曹操为此大发雷霆，专门派人到华佗家乡去调查。他对派去的人说：“如果华佗的妻子果然有病，就送给小豆四十斛，宽假限日，要是“虚诈”，就逮捕治罪。”
不久，华佗被抓到许昌，曹操仍旧请他治病。华佗诊断之后，说：“丞相的病已经很严重，不是针灸可以奏效的了。我想还是给你服下麻沸散，然后剖开头颅，施行手术，这才能除去病根。”曹操一听，勃然大怒，指着华佗厉声斥道：“头剖开了，人还能活吗？”他以为华佗要谋害他，就把华佗关到牢里去准备杀掉。曹操的一位谋士请求说：“佗方术实工，人命所悬，宜加全宥”。曹操不听，说：“不忧，天下当无此鼠辈邪？”竟然把这位在医学上有重大贡献的神医杀害了。
临行刑前，华佗把在狱中整理好的，记载自己一生行医经验和药方的医著交给牢头说：“此可以活人”，希望将它**监狱，以便流传于世。没想到，这个牢头害怕曹操知道被杀，不敢接受。华佗只好忍痛“索火烧之”。实在可惜啊！！！
而曹操自华陀辞世后，饱受头疼折磨，最后死于此病。
温院长又向树岩请教许多中医药方面和针灸医学的问题，显示了他渊博的中医知识。树岩明白，这个院长其实是在考自己，看这个“神医”是否浪得虚名。这些问题一点儿也难不住他，树岩曾经专门研究过论述中医药的《本草纲目》和《黄帝内经》中的《灵枢经》，也称为《针经》，是一部专门论述用微针治疗经络的著作。对树岩的回答，看来温院长相当满意。
“华老先生！本院能否荣幸聘请您来就任专家呢？”温院长笑眯眯地问，见树岩沉思不答，又劝道：“我们的医院很大，重病患者很多，有许多疑难杂症现在西医也无法根治！您在这里能更好地发挥，也能救治更多的病人啊！工资待遇方面有什么问题，您尽管提出来，我们尽量满足！”。
“如果温院长能答应老夫的两个条件，我可以来贵院。”树岩回答道。
“老先生请讲！”
“第一，你们医院能够治疗的普通病症，不要找我！我平时也不在医院坐诊，但有疑难病症的话，老夫保证随叫随到。”树岩喝了一口水，温院长满口答应他的这个条件，连说没问题。
“第二个条件比较麻烦，老夫每治好一个病人都要收取一些费用！收费的标准跟你们医院现在实行的不同，根据患者或家属经济条件和支付能力随时调整，一般收取财产的百分之十！另外，治病用的中草药由贵院提供，并按老夫要求保证质量！当然我说的中草药是指那些普通的，珍贵稀奇的不用劳烦你们。怎么样？温院长！”树岩来这里的目的就是赚零花钱，而不是图虚名，他可不想白白忙碌而不取分文。
温院长觉得这个老医生提出的这个条件实在是古怪，继而想深一层，也就明白了他的用意。医者治病而收取报酬，乃天经地义！而治疗绝症在一般的医院的花费，足以让工薪收入的普通家庭倾家荡产，还不能保证治好！这个华而实老先生提出的收费方法，实际上是变相的“杀富济贫”。富人多出钱，穷人少出钱，也就是“量体裁衣”，使社会上的弱势群体也能治大病！对现在的医疗体制是一大挑战啊！如果国家的医疗体制这样改革的话，保证大快人心！温院长也有一颗医者的仁心！他想到这里，对树岩的人格更加敬佩了！
“华老先生的第二个条件，我们也可以答应，并且患者支付的医疗费用我们医院分文不取，都转到先生账户上！不过……这患者或其家属的财产状况，我们没办法核实啊！老先生您看……？”温院长提出的问题确实是不好解决，不过这难不倒树岩，他早有打算。
靠！这点儿小问题，还能难倒本神医！
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