于《昭和十三年秋季以后对华处理办法》中，对停止转为战略保守后的基本政略、战略，特别是军事战略作了较为全面的规定，尤其是大本营方面要求在华日军必须着重于任何行动都必须按照上述原则执行。所以在武汉会战后的这年年底，正面战场上几乎是处于在一种彼此对峙的局面中。
于日军既已放弃战略进攻，不企图扩大占领地区，而是将主要着眼点转向确保占领区，并动用一切手段扑灭抗日的残余势力，摧毁中**队和民众的抗战企图，同时也要继续在正面战场上进行有限攻势的作战，并加强战略轰炸，对中国施加压力。所以长沙大火之后的第9战区一直处于在休整及与日军在西、湘北战场的对峙中，
日本人虽然停止了进攻，但却着手以‘以华制华’，侧重扶植亲日汉奸政权，试图从政治、文化等各方面笼络人心，以达到其征服中国的目的。无论是大本营方面的各类文件、还是政府的接连声明，谁都可以看得出来日本人所谓的‘主动指导新中国的建设’，便是首先就是指加强对汉奸伪政权的扶持。(全格式电子书下载)
除了北平的‘中华民国临时政府’、南京的名为‘中华民国维新政府’、张家口的‘蒙疆联合自治政府’等地的伪汉奸政权外，日本人最主要的知道思想是要成立一个大一统地伪中央政权，将各地方伪政权统一起来，以取代国民政府；如果无法达到取代的目的，也需要使国民政府地位下降，使其沦为地方政权。最终形成一个与满、蒙伪政权、日本一起构成地所谓‘大东亚新秩序圈’
而国民政府方面，鉴于广州、武汉失守后的形势，国民政府军事委员会于１１月１日至3日在长沙、25日至28日在南岳衡山，先后两次相继召开军事会议。按军委会的认为，会议的目的“就是要求得出一个以后作战可操必胜的具体方案”。
先，无论方案怎么样，国民政府都需要策定新的抗战指导方针，而蒋委员长在25日至28日的南岳军事会议上地讲话中，更是提出要把抗战全过程设想为两个时期，即自七七事变到武汉失守为第一期抗战，此后为第二期抗战。(手机WAP浏览)
尽管在第一期战斗过程中，中国虽然失了许多土地，死伤了许多同胞，表面上我们是失败了；但从整个长期的战局上说，是完全成功。最大地成功就是中国争取胜利战略上一切布置的完成，亦就是国民政府已经依照预定的战略陷敌军于困敝失败、莫能自拔的地位。
而第二期抗战，就是中国的转守为攻，转败为胜的时期。
于日军兵力的使用已经到了最大限度，今后日军再不能有更多的兵力使用到中国来，而且日本人已经派到中国境内的这许多部队随战区扩大而力量分散，陷入在敌后战场已疲惫不堪，所以日本人地侵略战争，今后只有一天天的随兵力之消耗减损而趋于失败。(全格式电子书下载)
在另一方面，中**队过去虽然遭受了挫失，但这些的挫失，客观上也只是到此限度为止；从今以后，由于作战经验的增加，战略布置的完成，以及军实的增强和敌我力量消长，士气盛衰对比，中国的胜利的把握和信心一天一天提高起来。
故而在这种指导思想下，南岳会议根据第一期抗战的经验教训和当前敌我态势及其发展趋向，策定第二期抗战的指导方针为连续发动有限度之攻势与反击，以牵制消耗敌人。策应敌后方之游击部队，加强敌后方之控制与袭扰，化敌后方为前方，迫敌局于前线，阻止其全面统制与物资掠夺，粉碎日军‘以华制华’、‘以战养战’之企图。同时还应该抽出部队，轮流整训，强化战力，准备总反攻。
总地战略仍然是持久战，但第二期抗战指导方针较之第一期有了更为积极的内容，其侧重点不再是以空间换取时间，而是以有限攻势和反击，与广泛地敌后游击战相结合，牵制消耗敌人，打破敌人的企图，并准备反攻。(更多新章节请到、搜/搜/九/九/九/)
根据这种指导思想，军委会做出了重划战区调整部署、简化指挥系统地排，这是敌我态势和新的作战方针知道下，军事委员会重新划分战区和兵力配备地安排。
第一战区，司令长官－卫立煌，辖区为豫、北一部，兵力１2个步兵师、１个骑兵师、１个步兵旅、１个骑兵旅及其他配属部队。
第二战区，司令长官－阎锡山，辖区为晋、陕一部，兵力32个步兵师、5个骑兵师、１步兵旅、3个骑兵旅及其他配属部队。
第三战区，司令长官－顾祝
区为苏南、南、赣东及浙、闽，兵力22个步兵师、及其他配属部队。
第四战区，司令长官－张发奎，辖区为粤、桂，兵力１8个步兵师、2个步兵旅及其他配属部队。(全部小说超速更新：搜/搜/9/9/9/COM)
第五战区，司令长官－李宗仁，辖区为西、鄂北、豫南，兵力34个步兵师、１个骑兵师、１个骑兵旅及其他配属部队。
第八战区，司令长官－朱绍良，辖区为甘、宁、青，兵力6个步兵师、骑兵师、9个步兵旅、骑兵旅及其他配属部队。
第九战区，司令长官－陈诚、代理司令长官－薛岳，辖区为赣西北、鄂南、湘北、湘东，兵力52个步兵师及其他配属部队
第十战区，司令长官－蒋鼎文，辖区陕、豫部分地区，兵力9个步兵师、１个骑兵师、１个步兵旅、１个骑兵旅。
新设敌后战区，鲁苏战区，总司令－于学忠，辖区为鲁南、苏北，兵力7个步兵师及游击部队。冀察战区，总司令－鹿钟麟，防区为冀、察地区，兵力5个步兵师、１个骑兵师、河北民军等力量。
另以9个步兵师、１个步兵旅担任川、、康大后方地区的警备；23个步兵师直属于最高军事委员会，为战略机动部队使用。(最新最全电子书下载S/O/S/O/9/9/9/.COM)
以上中**队全部兵力为242个师又40个旅，海、空军及炮兵等未计入其内。
同时，军事委员会还对军队的编制进行了检讨，以期改进指挥，提高效率，使统帅部和战区命令能迅速下达。这种检讨反思中，军事委员会认为原有的军事委员会、战区、兵团、集团军、军团、军到作为基本战略单位的师，共有7级指挥机构，层次太多、编制混乱，传达指挥不灵便，一道命令下来，往往被迟滞，甚是贻误战机，因此，军委会考虑取消兵团和军团两级，以军为基本战略单位；并撤消了军事委员会的湘、桂、陕、甘各地行营。改设桂林、天水两个行营，以分别指挥南北战场的作战。
同时，军委会认为一般步兵师中的旅一级在实战中功用不大，决定撤裁步兵师中的旅级单位，由师部直接指挥所属各团，使野战部队的指挥更为精干。
撤销师编成内的旅级机构，由师直接指挥团的思想虽然只是酝酿之中，但对下面的影响甚是巨大。因为旅部一裁，众多的旅长们就得各寻出路了，有点资历、有点才干的旅长可以升为副师长，但平庸之辈又该怎么处理，考虑再三之后，军委会决定比照日军的乙等师团编制，设置了步兵指挥官的职缺，旅长可以调任师步兵指挥官。
之前的国民政府师级编制便是对比日军的，日军为师团下辖步兵旅团、骑兵联队、炮兵联队、工兵联队、辎重兵联队等等，步兵旅团下辖为两个步兵联队，联队下辖三个步兵大队，步兵大队下面辖有步兵中队，中队以下为小队。
而国民政府军之前的编制是为师指挥两个旅，旅下面两个团，团下面三个营，营下辖连、连指挥排，排下面是基础作战单位－班。
而中日战争开始后，日军新设的部分特设师团、治安师团，便是三单位制（3个步兵联队）所编成的。参加武汉会战的第１5师团、第１7师团便是这种三单位师团。统一指挥步兵联队的单位是步兵团，而**的步兵指挥官的角色也就是类似于日军的步兵团长。
不过考虑到实施起来的具体操作性的原因，军委会的‘撤销旅级作战单位’决定，暂定于在民国28年（１939年）的年中再开始实施。
于抗战以来，中**队与优势日军作战迭经重大战役，兵员装备损失严重，多数部队因伤亡过重而缺额甚多，战斗力普遍下降，急需整理补充，以利再战。
按照委座在南岳军事会议上提出的“最大目的，就是要整理军队、建立军队，确立第二期抗战胜利的基础。全国部队今后拟分三期轮流整训，限期完成。
其办法即将全国现有部队之三分之一配备在游击区域－敌军的后方担任游击；以三分之一布置在前方，对敌抗战；而抽调三分之一到后方整训。等到第一批整训完成，仍调回前方作战，或担任游击。乃调换第二批到后方继续整训，每期整训期间，暂定为四个月，一年之内即须将全**队一律整训完成。”的思想，所以根据军委会的命令，第74军在内的众多第九战区部队纷纷展开轮流修整，补充兵员。()
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