杨玄感是炀帝已故宠臣、左仆射杨素长子，官至柱国将军、礼部尚书、世袭楚国公之爵，于朝中颇有身份，地位，突然造反，那强烈的震憾力，绝非一般庶民百姓起义可比。炀帝获报，大惊失色，未敢儿戏，未及多想，便断然舍弃眼看便可获得的重大战果，传旨全线退兵，集中全力平息内乱。由是，大军全线混乱，为了尽快退回本国，一路丢弃了几乎所有粮草、军帐、器械等军用物资，不亚于又打一场大败仗。
退军途中，炀帝正当心烦意乱、感叹忠臣良将难得之际，忽然接到李渊奏章，读完后，感慨不已，恰如漫漫长夜间突然发现一盏明灯，自思到底还是亲戚好，单以此事论，这位表弟便较其他官员可靠多了，内心深感宽慰，便下旨封李渊为纤化郡（今甘肃庆阳）留守，节制关中、陇右等地兵马，配合各路大军讨伐杨玄感。
正如宇文士及所言，杨玄感起兵前期，附近百姓因长期饱受劳役之灾，苦无出头之日，以至应者云集，兵力迅速达十余万众，堪称声势浩大。杨玄感得意之余，分兵连下慈涧、荥阳、虎牢（今河南荥阳汜水镇）等城，盛极一时，后来，却因长期攻打东都不下，被隋军左翊卫大将军宇文述、右武侯大将军屈突通、右骁卫大将军来护儿、京兆内史卫文升、虎贲郎将陈棱等领军分进合击，至终兵败自杀，杨氏合族二百余人悉数遇害，杨素与其父母、祖父母等先辈数代坟墓无一不被发掘，连死后多年还落下个戮尸碎骨的可悲结局。
平息这场叛乱，李渊虽也发兵，但未及与杨玄感叛军正面接触，此战便告平息。不过，平叛后，炀帝还是因李渊事前的主动上奏而对他赞赏有加，旨令调集河东一带隋军进击各地义军。至此，李渊方真正发自内心赞赏宇文士及的远见卓识，也暗自庆幸自己当初选择的明智，领旨后，迅速领军转战龙门（今山西河津），一战大败毋端儿农民军，进而于绛郡收编敬盘陀一支义军。李渊每至一地，总是军纪严明，严格约束部下与民为善，不得无故骚扰民众，非但于隋军各路人马间独树一帜，即便与各地义军相较，也堪称其中的佼佼者，从而深受百姓拥戴，广受传颂。
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